Ο Μητροπολίτης Προύσης Ναθαναήλ διορίστηκε στη θέση του Μητροπολίτη Θεσσαλονίκης, 6 Δεκεμβρίου 1891
Στις 6 Δεκεμβρίου 1891, ο Μητροπολίτης Προύσης Ναθαναήλ διορίστηκε στη θέση του Μητροπολίτη Θεσσαλονίκης, αντικαθιστώντας έναν από τους δύο εξαρχικούς Μητροπολίτες, Σωφρόνιο και Κωνσταντίνο, οι οποίοι ασχολούνταν με το Κοινοτικό ζήτημα της πόλης. Ο Ναθαναήλ είχε υπηρετήσει προηγουμένως ως Μητροπολίτης Σερρών από το 1879 έως το 1886 και ήταν ιδιαίτερα αγαπητός και σεβαστός από τους Σερραίους. Ο διορισμός του και η άφιξή του στη Θεσσαλονίκη προκάλεσαν χαρά στους Σερραίους και συνέβαλαν στην επίλυση των επίμαχων Κοινοτικών και Μητροπολιτικών ζητημάτων, καθώς και στον κατευνασμό των πνευμάτων στην περιοχή.